Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F

Job Description:

Description du poste

Domaine

Sciences du vivant

Contrat

Stage

Intitulé de l'offre

Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F

Sujet de stage

Le projet DYNAMO-RNAP s'appuie sur CREPE, notre plateforme propriétaire d'édition génomique à haut débit basée sur CRISPR-Cas9, ainsi que sur des systèmes automatisés de culture continue et le séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de générer une cartographie complète de l'impact des mutations, à la résolution d'un résidu, sur la fonction de l'ARN polymérase. L'étudiant(e) de Master 2 sélectionné(e) jouera un rôle central dans le déploiement à grande échelle de cette approche de Deep Mutational Scanning (DMS) afin de décrypter de manière systématique les interactions allostériques au sein de l'ARN polymérase.

Durée du contrat (en mois)

6

Description de l'offre

Formation M2 et périmètre du projet
Les principales missions seront les suivantes :

Clonage à haut débit et génération de banques de mutants : construire des banques exhaustives de mutations génomiques localisées et sans cicatrice (scarless) chez Escherichia coli.
Sélection automatisée : utiliser des turbidostats de culture continue de dernière génération pour réaliser des expériences compétitives parallélisées dans des conditions contrôlées de carence nutritionnelle et/ou de stress.
Séquençage profond génotype-phénotype : préparer et analyser des banques de séquençage d'amplicons à grande échelle (Illumina NovaSeq) afin de suivre l'évolution de la fréquence des variants au cours du temps.
Modélisation intégrative des données : exploiter Python (Pandas, Matplotlib/Seaborn) ainsi que des outils d'analyse structurale pour comprendre les effets des mutations sur la fonction de l'ARN polymérase.

Profil du candidat

Nous recherchons un(e) étudiant(e) ambitieux(se) et très motivé(e), actuellement inscrit(e) en Master 2 ou en école d'ingénieurs, avec une spécialisation en biologie des systèmes, biologie synthétique, microbiologie moléculaire, bio-ingénierie ou biotechnologies.

Compétences recherchées :

Compétences techniques (souhaitées, mais une formation sera assurée) : expérience pratique des techniques de base en biologie moléculaire (PCR, assemblage Gibson, transformation bactérienne).
Compétences en analyse de données : une familiarité avec Python et/ou R pour le traitement de données constitue un atout.
Langues : maîtrise du français et de l'anglais.

Pour plus d'informations, contactez :

Alaksh Choudhury
📧 achoudhu@genoscope.cns.fr

Localisation du poste

Site

Autre

Localisation du poste

France, Ile-de-France, Essonne (91)

Ville

EVRY

Critères candidat

Langues

Anglais (Courant)

Diplôme préparé

Bac+5 - Master 2

Formation recommandée

MASTER 2 ou Ecole Ingénieurs

Possibilité de poursuite en thèse

Non

Demandeur

Disponibilité du poste

01/10/2026