Stage - Ingénieur en chimie analytique/biochimie H/F

Descrizione del lavoro:

Description du poste

Domaine

Biologie, biophysique et biochimie

Contrat

Stage

Intitulé de l'offre

Stage - Ingénieur en chimie analytique/biochimie H/F

Sujet de stage

Échange hydrogène-deutérium couplé à la spectrométrie de masse appliqué à des biotoxines

Le stagiaire pourra prendre part aux missions d'un projet Fonds Européen de Défense de Recherche portant sur le développement de Contre-Mesures Médicales contre les menaces NRBC, et particulièrement les intoxications à l'abrine, la ricine et les neurotoxines botuliques bactériennes. Une maîtrise des enjeux de défense et de confidentialité connexes sera présentée le cas échéant.

Votre profil :
Étudiant en master 2/école d'ingénieur en chimie analytique/biochimie, avec un intérêt particulier pour la spectrométrie de masse et la caractérisation structurale.

Durée du contrat (en mois)

6 mois

Description de l'offre

Missions :
Les biotoxines sont des protéines composées d'une à deux chaînes polypeptidiques, dont la masse moléculaire est comprise entre 30 et 150 kDa, produites par des bactéries ou par des plantes. Elles se caractérisent par une toxicité importante, une action rapide et une grande diversité de séquences protéiques (nombreuses isoformes, types et sous-types). En cas d'intoxication due à une contamination accidentelle ou à une éventuelle attaque bioterroriste, les soins hospitaliers se limitent au rétablissement des fonctions vitales car il n'existe pas de contre-mesures médicales spécifiques capables de neutraliser chaque biotoxine. Il est essentiel de développer de nouvelles contre-mesures médicales, notamment des anticorps monoclonaux (mAbs) neutralisant les biotoxines.
La caractérisation structurale des biotoxines et l'identification des séquences peptidiques (épitopes) reconnues par les mAbs sont des prérequis lors du développement d'anticorps thérapeutiques. Dans cet objectif, vous concevrez une nouvelle méthode HDX-MS (échange hydrogène/deutérium couplé à la spectrométrie de masse) pour étudier les changements conformationnels de la biotoxine ciblée. Pour des raisons de biosécurité, des toxoïdes (formes non actives de la toxine) seront utilisés à la place de la toxine native.
La 1ère partie du stage consistera à développer un protocole de digestion des toxoïdes, afin de maximiser la couverture de la séquence protéique. Pour ce faire, différentes enzymes (pepsine, nepenthesine, protéase XIII et leurs combinaisons) ainsi que des tampons et des additifs seront évalués. Puis une optimisation chromatographique sera réalisée en comparant différents diamètres de colonnes (micro, capillaire et nano) ainsi que différentes phases stationnaires. Finalement, la méthode sera évaluée en termes de couverture de la séquence protéique des principaux types de la toxine et de stabilité de l'incorporation du deutérium, avant de l'appliquer à des analyses conformationnelles.

Pourquoi nous rejoindre ?
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Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés.

Localisation du poste

Site

Saclay

Localisation du poste

France

Ville

Saclay

Demandeur

Disponibilité du poste

01/02/2027